219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3205 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  35.04 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 168 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  40.8 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  41.46 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  45.45 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  42.42 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 193 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  34.65 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 154 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.74 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  44.83 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  36.27 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  37.21 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  33.94 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 166 aa  43.9  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>