More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1889 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  54.24 
 
 		 1224 aa  1124    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  56.25 
 
 		 1195 aa  1075    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  51.95 
 
 		 1181 aa  927    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  56.86 
 
 		 1194 aa  1136    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  55.63 
 
 		 1191 aa  1132    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.13 
 
 		 1172 aa  666    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  55.25 
 
 		 1217 aa  1082    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  54.37 
 
 		 1183 aa  968    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  50.8 
 
 		 1227 aa  961    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  55.18 
 
 		 1205 aa  1053    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  51.84 
 
 		 1203 aa  922    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  53.21 
 
 		 1191 aa  1004    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  50.56 
 
 		 1222 aa  913    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1214 aa  2365    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  57.01 
 
 		 1194 aa  1113    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  51.64 
 
 		 1213 aa  899    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  41.4 
 
 		 1225 aa  728    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  58.15 
 
 		 1199 aa  1193    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  56.71 
 
 		 1195 aa  1080    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.38 
 
 		 1195 aa  953    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  53.36 
 
 		 1191 aa  924    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  58.03 
 
 		 1194 aa  1214    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  54.12 
 
 		 1186 aa  956    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  50.28 
 
 		 1217 aa  925    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  55.44 
 
 		 1198 aa  1093    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  55.9 
 
 		 1198 aa  1093    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  58.47 
 
 		 1188 aa  1011    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  51.75 
 
 		 1222 aa  969    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.84 
 
 		 1188 aa  914    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  53.72 
 
 		 1188 aa  1071    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  56.71 
 
 		 1195 aa  1080    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  57.46 
 
 		 1194 aa  1117    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1187 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.9 
 
 		 1190 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  63.16 
 
 		 1218 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.38 
 
 		 1187 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.17 
 
 		 1176 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.88 
 
 		 1186 aa  446  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1188 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  63.72 
 
 		 1234 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1188 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 		 1148 aa  430  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.21 
 
 		 1173 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 		 1190 aa  426  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  45.27 
 
 		 1263 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.49 
 
 		 1177 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.25 
 
 		 1175 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1176 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1204 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 		 1177 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 		 1179 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.31 
 
 		 1178 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1167 aa  360  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 		 1167 aa  360  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 		 1181 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1186 aa  358  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  29.33 
 
 		 1168 aa  353  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  27.75 
 
 		 1195 aa  342  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.07 
 
 		 1167 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1167 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 		 1141 aa  335  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.78 
 
 		 1180 aa  331  5.0000000000000004e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29 
 
 		 1171 aa  331  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.46 
 
 		 1182 aa  329  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 		 1164 aa  327  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 		 1185 aa  313  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 		 1167 aa  308  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1154 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1185 aa  305  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1196 aa  300  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 		 1171 aa  296  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 		 1187 aa  294  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  34.99 
 
 		 1187 aa  290  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.52 
 
 		 1189 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.28 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  46.58 
 
 		 1174 aa  289  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  58.12 
 
 		 1186 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 		 1308 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.91 
 
 		 1174 aa  285  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.4 
 
 		 1189 aa  283  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.4 
 
 		 1189 aa  283  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.26 
 
 		 1174 aa  281  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.4 
 
 		 1189 aa  281  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.29 
 
 		 1189 aa  281  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.4 
 
 		 1189 aa  280  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.4 
 
 		 1189 aa  280  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.4 
 
 		 1189 aa  280  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1179 aa  280  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1191 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.78 
 
 		 1184 aa  275  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.73 
 
 		 1179 aa  274  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  43.31 
 
 		 1185 aa  270  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 		 1185 aa  268  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  42.68 
 
 		 1185 aa  268  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1172 aa  265  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.92 
 
 		 1189 aa  265  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.38 
 
 		 1189 aa  259  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.64 
 
 		 1174 aa  257  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>