158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4498 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  77.63 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  78.16 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  78.16 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  77.67 
 
 		 228 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  75 
 
 		 212 aa  332  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  48.24 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  51.76 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  38.97 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  44.52 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  58.14 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  48.98 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  43.4 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  30.4 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  30.4 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 469 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  36.25 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>