More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0445 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  39.75 
 
 		 1131 aa  713    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1016 aa  2065    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 1143 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  29.5 
 
 		 1124 aa  376  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  31.3 
 
 		 1153 aa  350  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 1080 aa  280  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  28.12 
 
 		 1051 aa  280  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 1086 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1086 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.49 
 
 		 1052 aa  260  9e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  27.92 
 
 		 1112 aa  259  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.2 
 
 		 1085 aa  257  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  27.01 
 
 		 1081 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  26.77 
 
 		 1128 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  27.29 
 
 		 1067 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.9 
 
 		 1100 aa  254  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 		 1075 aa  254  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  26.49 
 
 		 1083 aa  253  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  26.3 
 
 		 1089 aa  248  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1077 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 		 1053 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  29.13 
 
 		 1071 aa  245  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 1109 aa  243  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  26.63 
 
 		 1074 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  25.54 
 
 		 1127 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  28.38 
 
 		 853 aa  235  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27.82 
 
 		 1086 aa  234  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  27.3 
 
 		 1069 aa  234  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1072 aa  232  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  25.74 
 
 		 1082 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.29 
 
 		 1078 aa  230  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  27.13 
 
 		 1090 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 1075 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1065 aa  227  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  28.13 
 
 		 1077 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1140 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  28.54 
 
 		 1064 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.3 
 
 		 1099 aa  222  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  26.7 
 
 		 1087 aa  219  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  27.57 
 
 		 1065 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  27.39 
 
 		 1077 aa  216  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  27.01 
 
 		 1075 aa  211  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  28.17 
 
 		 1078 aa  210  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  26.97 
 
 		 1065 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  27.11 
 
 		 1060 aa  201  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.65 
 
 		 1160 aa  195  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.35 
 
 		 1117 aa  165  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28.23 
 
 		 1153 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  28.06 
 
 		 1109 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 		 963 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.25 
 
 		 969 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  32.99 
 
 		 1122 aa  115  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.52 
 
 		 1125 aa  110  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  24.69 
 
 		 696 aa  110  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  25.87 
 
 		 1160 aa  108  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 1172 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 		 560 aa  107  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  25.82 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 		 1170 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  25.65 
 
 		 560 aa  105  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.49 
 
 		 919 aa  104  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  25.3 
 
 		 560 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25 
 
 		 971 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  25.51 
 
 		 1170 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  25.48 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  25.65 
 
 		 560 aa  102  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  24.4 
 
 		 1172 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  25.48 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  25.48 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  25.48 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  25.92 
 
 		 1082 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  25.48 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  23.55 
 
 		 1062 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 		 1013 aa  100  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  24.63 
 
 		 1167 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  25 
 
 		 1168 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  24.27 
 
 		 975 aa  98.6  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  22.94 
 
 		 922 aa  98.6  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  21.89 
 
 		 889 aa  98.2  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  24.33 
 
 		 951 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  24.06 
 
 		 1170 aa  96.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 1169 aa  95.9  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  24.05 
 
 		 1167 aa  95.5  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  22.24 
 
 		 1065 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  22.24 
 
 		 1065 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1046 aa  95.9  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  24.48 
 
 		 1147 aa  95.5  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  25.73 
 
 		 1160 aa  95.1  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  25.21 
 
 		 953 aa  94.7  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1167 aa  94.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  28.73 
 
 		 1088 aa  94.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  24.77 
 
 		 963 aa  94.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  36.61 
 
 		 1037 aa  93.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  25.05 
 
 		 950 aa  93.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  22.11 
 
 		 877 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  23.37 
 
 		 669 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  23.74 
 
 		 988 aa  92.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  25.32 
 
 		 947 aa  91.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  24.11 
 
 		 1169 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  25.25 
 
 		 1145 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>