More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1210 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  54.19 
 
 		 1064 aa  1012    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  56.24 
 
 		 1053 aa  1078    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  48.91 
 
 		 1054 aa  983    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  55.23 
 
 		 1043 aa  1085    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1074 aa  2100    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  51.14 
 
 		 1050 aa  999    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  58.78 
 
 		 1040 aa  1169    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1121 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.23 
 
 		 1052 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 		 1033 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1063 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1063 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.02 
 
 		 1041 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1063 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1063 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1032 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1063 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  34.38 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1131 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1048 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1067 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1067 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1067 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  30.94 
 
 		 1044 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.97 
 
 		 1067 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1049 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1035 aa  529  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1055 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1030 aa  526  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.43 
 
 		 1067 aa  522  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  34.71 
 
 		 1075 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.99 
 
 		 1042 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 		 1137 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1041 aa  519  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1050 aa  515  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1053 aa  515  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  35.64 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1051 aa  512  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1033 aa  509  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.71 
 
 		 1034 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1063 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1035 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1068 aa  492  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 		 1034 aa  492  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1060 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1060 aa  486  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1062 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1053 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1057 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1041 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1073 aa  479  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1036 aa  475  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1054 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  34.48 
 
 		 1135 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1053 aa  462  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.21 
 
 		 1054 aa  459  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.35 
 
 		 1093 aa  459  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1061 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1033 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1060 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1048 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.04 
 
 		 1074 aa  445  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.96 
 
 		 1056 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1069 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1041 aa  442  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1066 aa  439  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  29.92 
 
 		 1048 aa  438  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  27.96 
 
 		 1050 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1052 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  29.18 
 
 		 1071 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1072 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27.54 
 
 		 1053 aa  406  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.12 
 
 		 1060 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1043 aa  364  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1098 aa  363  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1035 aa  353  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1044 aa  353  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1044 aa  349  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1038 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.2 
 
 		 1005 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.51 
 
 		 1049 aa  338  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1030 aa  330  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25 
 
 		 1050 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1025 aa  323  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1041 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1071 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1043 aa  321  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1095 aa  319  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1092 aa  319  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1034 aa  318  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1070 aa  318  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1069 aa  317  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.59 
 
 		 1069 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.3 
 
 		 1036 aa  314  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.75 
 
 		 1052 aa  311  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 		 1055 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1191 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  27.63 
 
 		 1042 aa  310  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1043 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1011 aa  309  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>