More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0709 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 192 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 192 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  52.81 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  48.35 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  37.25 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  60.34 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.9 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  53.33 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  56.36 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 280 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>