179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2869 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 230 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  38.6 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  30.68 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 249 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.51 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  35.85 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  29.9 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.88 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  30.34 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 272 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.52 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.29 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>