208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3437 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  100 
 
 		 487 aa  995    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.24 
 
 		 834 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  39.39 
 
 		 1426 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  40.34 
 
 		 1422 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.52 
 
 		 1322 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  40.34 
 
 		 1427 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  35.83 
 
 		 944 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  40.18 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  41.41 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  41.96 
 
 		 718 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  33.06 
 
 		 954 aa  77  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  36.73 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  48.24 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  43.18 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  41.03 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  46.34 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  48.53 
 
 		 3197 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.75 
 
 		 836 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  42.05 
 
 		 840 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  45.21 
 
 		 3197 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  43.21 
 
 		 938 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  39.58 
 
 		 951 aa  63.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  46.07 
 
 		 1053 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  51.47 
 
 		 856 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  44.3 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  51.56 
 
 		 884 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.43 
 
 		 835 aa  60.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  50 
 
 		 935 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  45.59 
 
 		 865 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  47.44 
 
 		 943 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40.48 
 
 		 1057 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  38.46 
 
 		 938 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  45.59 
 
 		 867 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  51.79 
 
 		 780 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  49.25 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  58.82 
 
 		 1916 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.76 
 
 		 942 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  65.91 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  51.56 
 
 		 936 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  51.56 
 
 		 936 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  40.74 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.46 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  64.44 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  64.44 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  64.44 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  57.14 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  40.86 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  44.78 
 
 		 1073 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  33.66 
 
 		 960 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.96 
 
 		 728 aa  57  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  41.11 
 
 		 917 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  63.41 
 
 		 777 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  47.69 
 
 		 918 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.37 
 
 		 639 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  37 
 
 		 944 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  54.55 
 
 		 965 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.74 
 
 		 945 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.77 
 
 		 940 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  37 
 
 		 944 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  46.88 
 
 		 820 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  37 
 
 		 944 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  32.93 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  42.65 
 
 		 871 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  50.85 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.67 
 
 		 773 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  38.74 
 
 		 1124 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  42.65 
 
 		 871 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  36 
 
 		 948 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  42.31 
 
 		 734 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  34.88 
 
 		 1104 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  34.88 
 
 		 1104 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  55.1 
 
 		 814 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.5 
 
 		 6885 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  36 
 
 		 944 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  39.76 
 
 		 967 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  45.68 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.97 
 
 		 1027 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  55.1 
 
 		 2066 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  37.33 
 
 		 1151 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.55 
 
 		 945 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1682 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  43.94 
 
 		 713 aa  53.9  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  44.05 
 
 		 517 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  43.75 
 
 		 869 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40 
 
 		 2272 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.86 
 
 		 892 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  38.96 
 
 		 818 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 		 2554 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  42.86 
 
 		 951 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  41.67 
 
 		 1441 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36 
 
 		 944 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  32.67 
 
 		 960 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  32.35 
 
 		 861 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  60 
 
 		 823 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  47.06 
 
 		 1200 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  32.67 
 
 		 960 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  51.92 
 
 		 792 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.66 
 
 		 835 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>