More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1186 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 612 aa  1264    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 562 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  22.39 
 
 		 579 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 577 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 582 aa  114  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  20.47 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.73 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.88 
 
 		 573 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1676 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.06 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.92 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 594 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 804 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 642 aa  69.7  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  31.97 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  23.72 
 
 		 586 aa  66.6  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 566 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  33.63 
 
 		 425 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 4079 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.56 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  20.47 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3840  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.745152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 		 557 aa  64.7  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.99 
 
 		 2240 aa  64.7  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.86 
 
 		 1694 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.17 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  33.96 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  27.69 
 
 		 584 aa  63.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.17 
 
 		 632 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.42 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.04 
 
 		 927 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  19.65 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.45 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  20.94 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 621 aa  60.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.03 
 
 		 882 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 883 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  28.39 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 864 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  34.07 
 
 		 1098 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.96 
 
 		 1737 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  20.68 
 
 		 934 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.42 
 
 		 936 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.38 
 
 		 935 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  23.55 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 864 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  25.66 
 
 		 609 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  22.18 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 571 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  18.64 
 
 		 1056 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  26.79 
 
 		 1160 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1138 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.48 
 
 		 988 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 612 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 3145 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 573 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 860 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 221 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  26.76 
 
 		 621 aa  54.3  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 573 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 416 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.65 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 613 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  26.76 
 
 		 621 aa  54.3  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  19.93 
 
 		 725 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 566 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 602 aa  53.9  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 564 aa  53.9  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 1096 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 581 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.67 
 
 		 887 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>