236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2460 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2460  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 485 aa  973    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 468 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.91 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2710  MATE efflux family protein  21.91 
 
 		 454 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1086  MATE efflux family protein  19.91 
 
 		 616 aa  84.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000719334  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  20.92 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  21.62 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1007  multi antimicrobial extrusion protein MatE  20.79 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  21.73 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.12 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  25.86 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  19.92 
 
 		 538 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.01 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.01 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.01 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.01 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.01 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  21.93 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.01 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  21.83 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22.35 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  21.47 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  20.86 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  20.27 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  20.27 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  21.23 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  21.33 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.51 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  19.69 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  20.77 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  23.05 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  21.91 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  20.72 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  21.92 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  20.48 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  23.4 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  21.53 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  23.98 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  21.7 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  21.61 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  22.47 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  23.4 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  19.95 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  19.09 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  23.15 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  20.05 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  19.71 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  20.89 
 
 		 442 aa  57  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  20.91 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  21.08 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  21.91 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  20.2 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  21.17 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  20.45 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  21.38 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  19.82 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  21.17 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  20.58 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  20.58 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>