More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1086 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1086  MATE efflux family protein  100 
 
 
616 aa  1244    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000719334  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2710  MATE efflux family protein  51.12 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223908  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1007  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41 
 
 
452 aa  364  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
468 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.1 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
462 aa  127  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.3 
 
 
453 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.16 
 
 
462 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.49 
 
 
455 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.02 
 
 
454 aa  106  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.49 
 
 
451 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
500 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  22.95 
 
 
457 aa  91.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.71 
 
 
500 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  25.41 
 
 
486 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.8 
 
 
477 aa  86.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  22.05 
 
 
525 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.26 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  21.98 
 
 
442 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  22.25 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  23.26 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  21.75 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
458 aa  80.1  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.8 
 
 
461 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  22.64 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  21.65 
 
 
453 aa  77  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.94 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  21.38 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.45 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  26.01 
 
 
480 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2460  multi anti extrusion protein MatE  19.69 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  20.67 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
521 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  21.56 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  25.62 
 
 
451 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  21.88 
 
 
460 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.14 
 
 
453 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  21.45 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  20.74 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  22.91 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.06 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  20.77 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1371  multidrug resistance protein NorM, putative  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  23.15 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1862  putative multidrug resistance protein NorM  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0035  putative multidrug resistance protein NorM  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0708926  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2217  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2255  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1133  putative multidrug resistance protein NorM  25.62 
 
 
451 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  21.21 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  23.23 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  22.09 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  18.65 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.37 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  23.42 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  22.92 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.12 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  20.69 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  21.93 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.99 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.64 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.3 
 
 
464 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  21.33 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  23.93 
 
 
463 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  22.04 
 
 
442 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  24.18 
 
 
466 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  23.57 
 
 
459 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  21.5 
 
 
448 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  22.75 
 
 
464 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  21.46 
 
 
461 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  21.93 
 
 
469 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
453 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  22.56 
 
 
448 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  26.45 
 
 
451 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  22.7 
 
 
500 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  23.04 
 
 
518 aa  65.1  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.8 
 
 
485 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  26.45 
 
 
451 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  20.22 
 
 
483 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.28 
 
 
475 aa  64.3  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  25.09 
 
 
478 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.36 
 
 
475 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  23.43 
 
 
456 aa  63.9  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  21.69 
 
 
469 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.63 
 
 
450 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.69 
 
 
469 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  23.6 
 
 
456 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>