159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1307 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1307  cellulose-binding family II  100 
 
 		 175 aa  344  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.530275  hitchhiker  0.00098691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  42.27 
 
 		 471 aa  75.1  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  39.8 
 
 		 456 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  38.78 
 
 		 422 aa  71.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.11 
 
 		 389 aa  67.8  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  39.81 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.83 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  46.32 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  36.67 
 
 		 681 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.04 
 
 		 437 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 439 aa  61.6  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  36.54 
 
 		 925 aa  61.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  36.67 
 
 		 438 aa  60.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  35.83 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  39.29 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  31.65 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  33.58 
 
 		 756 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  38.1 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  37.62 
 
 		 489 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 628 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 1055 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 812 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  39.29 
 
 		 774 aa  58.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1310  cellulose-binding family II  38.27 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  hitchhiker  0.00680399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  37.93 
 
 		 446 aa  57.8  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  34.69 
 
 		 623 aa  57.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  37.78 
 
 		 459 aa  57.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  36.46 
 
 		 353 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  39.8 
 
 		 656 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  39.8 
 
 		 678 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.37 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  40 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  38 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  34.65 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  40.22 
 
 		 673 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  34.69 
 
 		 842 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 		 620 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 		 778 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  35 
 
 		 743 aa  54.3  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.12 
 
 		 588 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  32.97 
 
 		 746 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  34.48 
 
 		 400 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  29.55 
 
 		 609 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  34.52 
 
 		 518 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  31.91 
 
 		 491 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  34.44 
 
 		 393 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  36.73 
 
 		 454 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 376 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  31.48 
 
 		 468 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  34.78 
 
 		 702 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  33.33 
 
 		 590 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  31.11 
 
 		 792 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  40.21 
 
 		 478 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  38.14 
 
 		 490 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  33.66 
 
 		 847 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  38.61 
 
 		 978 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  35.35 
 
 		 449 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  32.65 
 
 		 467 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  32.32 
 
 		 347 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  35.96 
 
 		 536 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  32.65 
 
 		 372 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  31.68 
 
 		 488 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  34.78 
 
 		 669 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  34 
 
 		 403 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 589 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  31.31 
 
 		 773 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  37.11 
 
 		 374 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  34.33 
 
 		 451 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  36.47 
 
 		 608 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 934 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  37.76 
 
 		 854 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  33.33 
 
 		 596 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  35 
 
 		 466 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 854 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  37.76 
 
 		 457 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  34.12 
 
 		 485 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  30.59 
 
 		 469 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.67 
 
 		 979 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  34.34 
 
 		 441 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.38 
 
 		 984 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  36.84 
 
 		 880 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  35.37 
 
 		 781 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  34.44 
 
 		 448 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  31.96 
 
 		 851 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  33.33 
 
 		 854 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  31.33 
 
 		 442 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  32.99 
 
 		 593 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  34.62 
 
 		 911 aa  47.8  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 349 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 846 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  30.77 
 
 		 613 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.62 
 
 		 2305 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  32.08 
 
 		 767 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  29.51 
 
 		 794 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  30.95 
 
 		 913 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  34.12 
 
 		 495 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  30 
 
 		 580 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  37.5 
 
 		 655 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>