238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0524 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  44.14 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  29.68 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  26.29 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  32.03 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.29 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  30.23 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  28.22 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  33.02 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  26.24 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.58 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 470 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  20.73 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  26.42 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 333 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>