More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2073 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  62.7 
 
 		 1004 aa  1217    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1000 aa  2037    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 922 aa  459  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 939 aa  426  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 920 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 987 aa  337  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 944 aa  310  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 966 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 957 aa  283  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 951 aa  282  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 947 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 946 aa  269  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 976 aa  264  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 1015 aa  263  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 976 aa  261  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 951 aa  260  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 935 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 967 aa  254  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 998 aa  238  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  29.42 
 
 		 1007 aa  237  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 938 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 1020 aa  234  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 969 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1007 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1057 aa  229  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1007 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1028 aa  225  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1007 aa  225  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1009 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 953 aa  214  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 935 aa  211  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.11 
 
 		 961 aa  207  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.15 
 
 		 880 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 1040 aa  201  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 966 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 952 aa  188  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 981 aa  188  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 879 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 933 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 907 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 987 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 940 aa  182  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 1041 aa  181  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 937 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 985 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 914 aa  168  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 1088 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 913 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 1034 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 966 aa  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.06 
 
 		 929 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.8 
 
 		 969 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 950 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 1064 aa  153  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 927 aa  152  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 824 aa  152  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 903 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 906 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 874 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 901 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  24.9 
 
 		 877 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 966 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 948 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 904 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 883 aa  145  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 883 aa  145  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 883 aa  145  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 897 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 981 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.65 
 
 		 884 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 928 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 1015 aa  141  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 869 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 964 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 924 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 884 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 1006 aa  134  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 1032 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.46 
 
 		 914 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 901 aa  132  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 873 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 948 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  24.35 
 
 		 922 aa  129  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 893 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.73 
 
 		 853 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 836 aa  126  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1020 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 853 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 965 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 901 aa  125  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 956 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 853 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 853 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 853 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 925 aa  121  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 873 aa  121  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 975 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 843 aa  118  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>