156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2061 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  68.77 
 
 		 789 aa  1073    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  75.2 
 
 		 797 aa  1123    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  100 
 
 		 796 aa  1590    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  68.29 
 
 		 797 aa  1063    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  64.71 
 
 		 789 aa  934    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  69.83 
 
 		 788 aa  1070    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  70.57 
 
 		 789 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  68.54 
 
 		 788 aa  1075    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  69.67 
 
 		 787 aa  1025    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  68.89 
 
 		 785 aa  1080    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.61 
 
 		 831 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.95 
 
 		 806 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.72 
 
 		 837 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  17.52 
 
 		 808 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.44 
 
 		 764 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  22.5 
 
 		 697 aa  124  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.2 
 
 		 773 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.12 
 
 		 872 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.64 
 
 		 755 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.4 
 
 		 815 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.09 
 
 		 828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.32 
 
 		 807 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.41 
 
 		 779 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.03 
 
 		 779 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.82 
 
 		 792 aa  104  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  19.8 
 
 		 789 aa  98.6  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.1 
 
 		 825 aa  98.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.65 
 
 		 821 aa  97.8  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  20.92 
 
 		 752 aa  93.2  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  21.58 
 
 		 823 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.12 
 
 		 813 aa  92.4  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  21.55 
 
 		 823 aa  91.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.81 
 
 		 800 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  19.68 
 
 		 821 aa  89.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.5 
 
 		 803 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  21.23 
 
 		 823 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.31 
 
 		 835 aa  87.8  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  20.22 
 
 		 824 aa  87.4  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.62 
 
 		 788 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.93 
 
 		 967 aa  87.4  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.29 
 
 		 778 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.08 
 
 		 764 aa  85.5  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.29 
 
 		 816 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.94 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.46 
 
 		 807 aa  84.3  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.16 
 
 		 762 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.96 
 
 		 811 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.97 
 
 		 765 aa  82.4  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  19.13 
 
 		 755 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.58 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  18.55 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.21 
 
 		 752 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.27 
 
 		 800 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.62 
 
 		 1051 aa  73.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.17 
 
 		 820 aa  72  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.11 
 
 		 756 aa  72  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  23.68 
 
 		 786 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  23.68 
 
 		 786 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  20.38 
 
 		 778 aa  69.7  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  22.44 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.03 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  20.33 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  25.23 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  20.98 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  24.32 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  23.03 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  23.3 
 
 		 804 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  23.75 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.06 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.64 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20.74 
 
 		 799 aa  64.7  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  18.98 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  22.64 
 
 		 758 aa  64.3  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  19.82 
 
 		 816 aa  63.9  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.46 
 
 		 772 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.59 
 
 		 898 aa  63.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.9 
 
 		 812 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  22.93 
 
 		 380 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.07 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  21.2 
 
 		 794 aa  62  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  18.62 
 
 		 746 aa  61.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.36 
 
 		 776 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  20.39 
 
 		 768 aa  60.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  18.81 
 
 		 795 aa  60.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  21.03 
 
 		 740 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  23.31 
 
 		 804 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  23.11 
 
 		 786 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.56 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  19.95 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  22.85 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.76 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  21.08 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  22.12 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  22.58 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  22.58 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  19.89 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  20 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.64 
 
 		 905 aa  57.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  24.76 
 
 		 797 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  20.72 
 
 		 790 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>