90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0168 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 883 aa  1730    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  42.77 
 
 		 856 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  41.41 
 
 		 831 aa  509  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  34.72 
 
 		 897 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  29.97 
 
 		 568 aa  134  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  24.5 
 
 		 734 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  28.88 
 
 		 955 aa  118  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  29 
 
 		 661 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  25.05 
 
 		 728 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  26.98 
 
 		 1187 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  25.56 
 
 		 734 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  25.96 
 
 		 572 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  27.08 
 
 		 831 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  26.73 
 
 		 941 aa  90.1  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  24.51 
 
 		 787 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  24.49 
 
 		 733 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21.93 
 
 		 796 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  24.7 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  24.16 
 
 		 801 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  25.76 
 
 		 819 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  24.09 
 
 		 916 aa  82.4  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06929  conserved hypothetical protein  36.52 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.587599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 		 793 aa  81.3  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  27.44 
 
 		 949 aa  80.1  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  26.47 
 
 		 826 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 755 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  24.52 
 
 		 910 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  21.09 
 
 		 876 aa  75.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  26.65 
 
 		 901 aa  75.5  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  26.49 
 
 		 936 aa  75.1  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  23.72 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  21.22 
 
 		 926 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  27.1 
 
 		 757 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  26.25 
 
 		 757 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  21.67 
 
 		 775 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  26.94 
 
 		 832 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  26.8 
 
 		 1188 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  26.4 
 
 		 763 aa  68.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.96 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  34.48 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  24.92 
 
 		 904 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2336  alpha-L-rhamnosidase  22.2 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  27.11 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10867  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  24.91 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  37.29 
 
 		 880 aa  58.9  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  25.25 
 
 		 829 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  22.94 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  25.42 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0445  hypothetical protein  22.08 
 
 		 593 aa  57.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  29.56 
 
 		 1118 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  34.23 
 
 		 959 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  23.23 
 
 		 935 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3982  alpha-L-rhamnosidase  22.35 
 
 		 553 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0704694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  21.82 
 
 		 916 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  37.93 
 
 		 1061 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  25.78 
 
 		 855 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.08 
 
 		 1429 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.47 
 
 		 1507 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  23.35 
 
 		 941 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  42.11 
 
 		 774 aa  52.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  21.11 
 
 		 914 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  27.13 
 
 		 1107 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  23.75 
 
 		 910 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  22.65 
 
 		 931 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.21 
 
 		 691 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  21.45 
 
 		 923 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.48 
 
 		 834 aa  48.9  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  29.63 
 
 		 770 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1020  hypothetical protein  31.34 
 
 		 730 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  26.14 
 
 		 774 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.79 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  22.79 
 
 		 675 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  24.4 
 
 		 918 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.79 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0301  hypothetical protein  26.49 
 
 		 774 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  30.95 
 
 		 910 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0066  hypothetical protein  26.18 
 
 		 584 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  20.16 
 
 		 610 aa  47  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  24.11 
 
 		 802 aa  46.2  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  38.24 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  22.06 
 
 		 770 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.06 
 
 		 797 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  24.11 
 
 		 802 aa  45.8  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.42 
 
 		 720 aa  45.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.06 
 
 		 770 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  33.04 
 
 		 895 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  27.86 
 
 		 971 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03780  rhamnosidase B, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05040)  25.69 
 
 		 836 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  26.62 
 
 		 758 aa  45.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  25.79 
 
 		 790 aa  45.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>