More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1323 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  100 
 
 		 604 aa  1239    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  52.28 
 
 		 568 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  51.23 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  51.23 
 
 		 570 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  48.68 
 
 		 563 aa  545  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  48.87 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  47.74 
 
 		 539 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  48.75 
 
 		 560 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  49 
 
 		 560 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  45.81 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  46.62 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  43.87 
 
 		 605 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  46.45 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  43.22 
 
 		 593 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.95 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  44.94 
 
 		 566 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  43.53 
 
 		 544 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  44.64 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  45.86 
 
 		 576 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  42.41 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  45.42 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  44.19 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  45.31 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 550 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  45.99 
 
 		 565 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  44.78 
 
 		 533 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  45.75 
 
 		 522 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  43.86 
 
 		 543 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  45.28 
 
 		 544 aa  445  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  44.57 
 
 		 607 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  43.57 
 
 		 538 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  44.43 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  43.57 
 
 		 560 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  42.72 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  42.74 
 
 		 545 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  45.24 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  44.62 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 542 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  43.41 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  43.03 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  42.5 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  44.83 
 
 		 561 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  43.09 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  43.47 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  43.81 
 
 		 555 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  43.42 
 
 		 640 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  40.96 
 
 		 587 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  41.4 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  42.4 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  42.27 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  42.56 
 
 		 599 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  42.72 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  41.56 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  41.27 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  39.28 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  41.27 
 
 		 561 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  42.14 
 
 		 532 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  41.76 
 
 		 580 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  40.42 
 
 		 634 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  40.03 
 
 		 548 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  38.85 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  43.5 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  38.63 
 
 		 543 aa  339  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.65 
 
 		 536 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  35.47 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  35.56 
 
 		 540 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  36.41 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  34.41 
 
 		 538 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  35.26 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  34.89 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  33.39 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 545 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  32.64 
 
 		 543 aa  283  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  34.07 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  37.04 
 
 		 535 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 		 538 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  38.19 
 
 		 541 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  35.57 
 
 		 542 aa  277  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  38.34 
 
 		 542 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  39.82 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 		 560 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  33.33 
 
 		 539 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  37.98 
 
 		 540 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  34.49 
 
 		 547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  35.36 
 
 		 562 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  39.41 
 
 		 540 aa  270  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  39.35 
 
 		 528 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  33.44 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  34.39 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  30.42 
 
 		 535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  34.21 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  35.03 
 
 		 540 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  37.01 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 		 563 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  34.84 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>