More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06935 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  92.38 
 
 		 446 aa  826    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 446 aa  884    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  51.36 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  52.03 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  52.03 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  51.8 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  50.45 
 
 		 453 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  51.13 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  51.13 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  51.13 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  51.34 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  39.4 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  34.7 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 464 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  33.41 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  33.49 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  32.95 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  32.49 
 
 		 463 aa  249  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 464 aa  236  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  29.22 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  31.14 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  29.52 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  30.68 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.64 
 
 		 555 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 464 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  26.96 
 
 		 438 aa  152  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  27 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  26.92 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 461 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 453 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 450 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.83 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25 
 
 		 454 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.57 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  25.57 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  25.23 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 445 aa  107  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.56 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.66 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  23.88 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  23.88 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 459 aa  99.8  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.76 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  23.88 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.66 
 
 		 495 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 467 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  24.2 
 
 		 429 aa  97.8  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 459 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  23.8 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.28 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.71 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.47 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 462 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.71 
 
 		 546 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>