More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4160 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 872 aa  1683    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 895 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 864 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 881 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 866 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  34.62 
 
 		 862 aa  347  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  36.55 
 
 		 872 aa  336  9e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 867 aa  331  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 992 aa  148  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 970 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.51 
 
 		 1005 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 954 aa  101  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 983 aa  101  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 973 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.45 
 
 		 1123 aa  97.8  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.61 
 
 		 1123 aa  94.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  32.28 
 
 		 967 aa  94.4  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.03 
 
 		 1114 aa  92.8  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  34.07 
 
 		 957 aa  91.3  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  32.51 
 
 		 937 aa  88.2  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 967 aa  88.2  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.09 
 
 		 916 aa  87.4  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.18 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.93 
 
 		 852 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 1015 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 981 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.77 
 
 		 1075 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  30.91 
 
 		 964 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 940 aa  82  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.79 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 1022 aa  80.9  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 		 959 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 952 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  31.01 
 
 		 963 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.93 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.17 
 
 		 713 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.36 
 
 		 1067 aa  78.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.89 
 
 		 1105 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 1116 aa  78.2  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.67 
 
 		 919 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  30.51 
 
 		 963 aa  77.8  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 		 974 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.4 
 
 		 1175 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.72 
 
 		 1034 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 1118 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.62 
 
 		 1055 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 		 1050 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.72 
 
 		 1050 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 1190 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.92 
 
 		 1089 aa  76.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 		 982 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 1096 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29 
 
 		 1089 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.57 
 
 		 1020 aa  75.1  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  30.74 
 
 		 1051 aa  74.3  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 1193 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.77 
 
 		 1134 aa  74.3  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  33.81 
 
 		 977 aa  73.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 		 998 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 900 aa  72.4  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.63 
 
 		 1071 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 927 aa  72  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.4 
 
 		 922 aa  71.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 		 1160 aa  71.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 953 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  40.12 
 
 		 1006 aa  70.5  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 909 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.49 
 
 		 1013 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.33 
 
 		 1141 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  40.46 
 
 		 973 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.58 
 
 		 1163 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.93 
 
 		 220 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  33.97 
 
 		 1139 aa  70.1  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  29.23 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.14 
 
 		 1081 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  33.68 
 
 		 1118 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  33.68 
 
 		 1118 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.55 
 
 		 1093 aa  68.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.27 
 
 		 1080 aa  68.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.6 
 
 		 1029 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  33.46 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 946 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 919 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.17 
 
 		 919 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.17 
 
 		 919 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 211 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  26.09 
 
 		 1143 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  45.26 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.64 
 
 		 1836 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.27 
 
 		 1053 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 948 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 236 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 1000 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 1161 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 1141 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.02 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 1141 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 947 aa  65.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  50 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>