More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3449 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 240 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 252 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  41.63 
 
 		 260 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 770 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.69 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 418 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 453 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
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NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
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NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
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NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  23.73 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
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NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
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