157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1962 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 411 aa  818    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  84.96 
 
 		 524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  45.19 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  61.93 
 
 		 334 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  68.09 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  66.84 
 
 		 767 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  58.6 
 
 		 333 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  60.98 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  57.27 
 
 		 233 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  61.58 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  60.42 
 
 		 494 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  52.12 
 
 		 338 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  53.85 
 
 		 1001 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  58.06 
 
 		 221 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  57.45 
 
 		 692 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  53.08 
 
 		 225 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  46.61 
 
 		 357 aa  190  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  48.98 
 
 		 356 aa  186  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  50.26 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 683 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  47.45 
 
 		 1160 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  44.34 
 
 		 212 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  45.97 
 
 		 212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  42.79 
 
 		 337 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  56.43 
 
 		 566 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  49.32 
 
 		 582 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  50 
 
 		 503 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  44.6 
 
 		 1413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  47.48 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  43.36 
 
 		 1139 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  44.83 
 
 		 497 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  45.65 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.51 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.57 
 
 		 520 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.71 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  42.75 
 
 		 691 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  44.2 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  43.48 
 
 		 503 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  40.94 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.29 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  42.45 
 
 		 789 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  44.06 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  42.55 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  39.73 
 
 		 569 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.84 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  42.66 
 
 		 897 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  40.14 
 
 		 571 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  40.88 
 
 		 1259 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 491 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  41.61 
 
 		 563 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.42 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 494 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  41.96 
 
 		 615 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  39.22 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  39.57 
 
 		 863 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.01 
 
 		 695 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  38.26 
 
 		 963 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  40.29 
 
 		 982 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.88 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  31.98 
 
 		 737 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  32 
 
 		 274 aa  86.3  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.46 
 
 		 514 aa  86.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  35.81 
 
 		 943 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  36.84 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.11 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 672 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.24 
 
 		 507 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.5 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  34.29 
 
 		 2073 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  40.46 
 
 		 957 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  39.69 
 
 		 884 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  37.96 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.89 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  34.27 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  37.7 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  36.3 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  39.72 
 
 		 1187 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.38 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  30.82 
 
 		 644 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.81 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.65 
 
 		 801 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.71 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.09 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32.58 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.86 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  30 
 
 		 1016 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  34.23 
 
 		 664 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.57 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.33 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  31.91 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  34.92 
 
 		 1222 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.58 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  33.12 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.64 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  29.73 
 
 		 744 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  30.22 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.58 
 
 		 1567 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  28.08 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  30.83 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>