More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1936 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  100 
 
 		 486 aa  943    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  67.21 
 
 		 485 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  64.69 
 
 		 499 aa  614  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  59.68 
 
 		 498 aa  565  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  57.56 
 
 		 518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  62.55 
 
 		 490 aa  556  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  54.64 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  57.56 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  44.21 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  42.2 
 
 		 538 aa  334  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  41.26 
 
 		 554 aa  334  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  41.89 
 
 		 485 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  42.7 
 
 		 525 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  38.57 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  37.73 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  38.93 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 468 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 505 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 462 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 455 aa  246  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  32 
 
 		 477 aa  220  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  30.69 
 
 		 496 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  31.05 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 462 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 462 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  32.16 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  29.39 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  28.29 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  28.07 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  28.07 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  28.07 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.07 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.41 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.33 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.41 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  30.94 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  33.87 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 469 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 469 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 455 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 463 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  34.08 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 476 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  32.96 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 472 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  31.18 
 
 		 436 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  32.02 
 
 		 503 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>