More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3276 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  100 
 
 		 457 aa  910    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  40.63 
 
 		 449 aa  356  5.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  36.36 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  37.07 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  36.2 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  37.08 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  32.24 
 
 		 477 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  31.53 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  34.74 
 
 		 522 aa  196  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  31 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  30.71 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 446 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  35.02 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.64 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.3 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 469 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.3 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.09 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.09 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.09 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  33.62 
 
 		 408 aa  167  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.09 
 
 		 469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.09 
 
 		 469 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.54 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  28.92 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.29 
 
 		 503 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.91 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  27.09 
 
 		 491 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 500 aa  133  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 503 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  25.68 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.26 
 
 		 473 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 465 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 458 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.01 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>