240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1882 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 805 aa  1583    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  31.69 
 
 		 790 aa  281  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  30.29 
 
 		 794 aa  272  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  30.13 
 
 		 795 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  29.26 
 
 		 795 aa  251  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  24.82 
 
 		 784 aa  164  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  23.74 
 
 		 804 aa  89.7  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.89 
 
 		 864 aa  88.6  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  22.84 
 
 		 702 aa  83.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.56 
 
 		 702 aa  84  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.96 
 
 		 702 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.34 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  23.56 
 
 		 993 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.82 
 
 		 993 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  38.14 
 
 		 1146 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  27.91 
 
 		 910 aa  67.4  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  21.92 
 
 		 993 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1146 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.54 
 
 		 978 aa  63.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  37.37 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  28.57 
 
 		 1025 aa  62  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.42 
 
 		 1189 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.08 
 
 		 1174 aa  60.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  22.97 
 
 		 994 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.16 
 
 		 961 aa  60.1  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 906 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.24 
 
 		 1187 aa  60.1  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.6 
 
 		 1189 aa  59.3  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.41 
 
 		 1108 aa  58.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  31.55 
 
 		 1061 aa  58.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1147 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  23.38 
 
 		 1191 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1189 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  34.21 
 
 		 1149 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  25.73 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  24.03 
 
 		 1175 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  22.89 
 
 		 1189 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  26.95 
 
 		 700 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.86 
 
 		 1189 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  23.93 
 
 		 1191 aa  55.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 		 812 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.86 
 
 		 1189 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  22.16 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  40.98 
 
 		 1200 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 1180 aa  55.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  31.86 
 
 		 980 aa  55.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  24.41 
 
 		 1183 aa  54.7  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  27.57 
 
 		 1223 aa  54.7  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  22.41 
 
 		 895 aa  54.7  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.97 
 
 		 1189 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.97 
 
 		 1189 aa  54.3  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.97 
 
 		 1189 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.97 
 
 		 1189 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.97 
 
 		 1189 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.76 
 
 		 926 aa  54.3  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 		 1190 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  27.81 
 
 		 1081 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1186 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.22 
 
 		 1019 aa  53.9  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 		 1255 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1184 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1185 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  36.62 
 
 		 1100 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  25.93 
 
 		 986 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  28.65 
 
 		 962 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.74 
 
 		 1184 aa  53.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.38 
 
 		 904 aa  53.5  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  23.51 
 
 		 1199 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  45.9 
 
 		 1209 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  25.91 
 
 		 851 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 		 1185 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.73 
 
 		 1074 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1185 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.63 
 
 		 1185 aa  52.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.6 
 
 		 1057 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.22 
 
 		 1049 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 		 1188 aa  52.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 		 1201 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 		 1188 aa  52.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30.97 
 
 		 1180 aa  52  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  25.66 
 
 		 852 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 		 1172 aa  52  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.41 
 
 		 1174 aa  52  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.81 
 
 		 924 aa  52.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  35.8 
 
 		 1226 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1192 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  25.66 
 
 		 852 aa  52.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  35.8 
 
 		 1226 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.85 
 
 		 1029 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1181 aa  51.6  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1217 aa  51.6  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  51.06 
 
 		 339 aa  51.6  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  24.7 
 
 		 1188 aa  52  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  23.23 
 
 		 1181 aa  51.6  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  25.83 
 
 		 1195 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  33.04 
 
 		 1178 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  25.83 
 
 		 1195 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  25.83 
 
 		 1195 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.09 
 
 		 1187 aa  51.2  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  23.21 
 
 		 1198 aa  51.2  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>