282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6436 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  50 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  41.12 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.56 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.29 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  31.82 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  34.67 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0651  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  36.89 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.84 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.95 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.7 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  25.51 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  25.93 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.05 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  30.65 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>