246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2852 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  100 
 
 		 1152 aa  2275    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  70.9 
 
 		 465 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  41.9 
 
 		 1223 aa  353  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  50.9 
 
 		 1406 aa  347  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 		 477 aa  261  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  39.74 
 
 		 460 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  37.53 
 
 		 2690 aa  233  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  36.18 
 
 		 846 aa  211  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  39.58 
 
 		 1285 aa  205  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  45.8 
 
 		 1362 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  34.97 
 
 		 846 aa  193  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  34.03 
 
 		 846 aa  191  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  32.44 
 
 		 848 aa  184  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  39.89 
 
 		 1146 aa  183  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  35.17 
 
 		 1219 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  39.29 
 
 		 675 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  39.95 
 
 		 1096 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  41.13 
 
 		 1127 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  45.3 
 
 		 482 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  40.35 
 
 		 1127 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  39.38 
 
 		 1047 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  40.14 
 
 		 1127 aa  169  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  40.78 
 
 		 1127 aa  169  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  39 
 
 		 1059 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  28.09 
 
 		 543 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 1129 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  45.77 
 
 		 1054 aa  147  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  42.79 
 
 		 1123 aa  147  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  28.49 
 
 		 417 aa  144  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  46.27 
 
 		 1053 aa  142  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  43.9 
 
 		 1051 aa  139  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.26 
 
 		 1143 aa  134  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  31.17 
 
 		 453 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  31.17 
 
 		 453 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  31.33 
 
 		 609 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  31.17 
 
 		 453 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  30.23 
 
 		 463 aa  132  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  32.36 
 
 		 1771 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  30.2 
 
 		 453 aa  129  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  30.67 
 
 		 453 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  29.7 
 
 		 453 aa  125  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  27.12 
 
 		 691 aa  121  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  34.29 
 
 		 991 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 511 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  27.37 
 
 		 571 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  58.59 
 
 		 778 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 		 1224 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.72 
 
 		 12684 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.43 
 
 		 979 aa  106  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30.41 
 
 		 1474 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  37.7 
 
 		 1141 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 408 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  55.88 
 
 		 1132 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1204 aa  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  62.64 
 
 		 1414 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  29.63 
 
 		 1585 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  29.85 
 
 		 1217 aa  101  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  25.17 
 
 		 962 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  35.9 
 
 		 1247 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  34.19 
 
 		 499 aa  100  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  31.47 
 
 		 1748 aa  99.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.18 
 
 		 915 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  51.96 
 
 		 1275 aa  98.2  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  39.15 
 
 		 343 aa  97.8  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  52.83 
 
 		 1002 aa  94.7  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  26.67 
 
 		 14944 aa  93.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.78 
 
 		 703 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1452 aa  93.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.71 
 
 		 1295 aa  92.8  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.83 
 
 		 984 aa  92  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1124 aa  92  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.31 
 
 		 1107 aa  91.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  38.19 
 
 		 1601 aa  90.1  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  28.52 
 
 		 376 aa  89.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  45.83 
 
 		 587 aa  89  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  29.58 
 
 		 398 aa  88.2  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.82 
 
 		 3793 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  22.62 
 
 		 831 aa  85.9  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 1129 aa  85.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  48.84 
 
 		 692 aa  85.1  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 966 aa  85.1  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.76 
 
 		 3562 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.24 
 
 		 2927 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  44.35 
 
 		 974 aa  84  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.75 
 
 		 4106 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.46 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.97 
 
 		 1565 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.5 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 		 963 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.98 
 
 		 3325 aa  78.2  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  26.34 
 
 		 432 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  30.36 
 
 		 390 aa  77.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.11 
 
 		 1597 aa  77  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.63 
 
 		 5559 aa  77.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.63 
 
 		 5559 aa  76.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  22.92 
 
 		 2656 aa  76.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.57 
 
 		 5561 aa  75.5  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  24.89 
 
 		 2807 aa  75.1  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.56 
 
 		 5561 aa  75.1  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>