More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3137 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3137  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.14 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  50.34 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0219  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.77 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.855188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0075  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.79 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  50.36 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.4 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0893  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  47.14 
 
 		 315 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187565  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  52.25 
 
 		 305 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2697  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  49.45 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2388  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.15 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1541  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  49.08 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2112  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.15 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  48.94 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  50.76 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3658  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  47.87 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1421  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  49.08 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  50.37 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2945  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  48.94 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.992735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0092  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  48.82 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  48.74 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  47.93 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1627  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  51.08 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0844583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2399  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  45.02 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  45.22 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2812  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  46.18 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  43.34 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  36.18 
 
 		 171 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  40.38 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  37.58 
 
 		 199 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 591 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 		 593 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  36.42 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  42.45 
 
 		 187 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  39.02 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  37.8 
 
 		 552 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  37.35 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  39.04 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 		 594 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  39.73 
 
 		 200 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  39.04 
 
 		 203 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  40.46 
 
 		 179 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  43.84 
 
 		 224 aa  99  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  38.36 
 
 		 200 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  39.73 
 
 		 201 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  38.51 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  36.25 
 
 		 196 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  37.67 
 
 		 204 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  36.81 
 
 		 197 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  35 
 
 		 196 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  37.13 
 
 		 178 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  34.34 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  36.42 
 
 		 195 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  34.44 
 
 		 168 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  37.75 
 
 		 173 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 615 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  36.47 
 
 		 179 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  32.14 
 
 		 169 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  37.5 
 
 		 192 aa  92.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  36.99 
 
 		 579 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  35.29 
 
 		 192 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0395  shikimate kinase  45.21 
 
 		 214 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.3 
 
 		 604 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  30.2 
 
 		 172 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  36.71 
 
 		 207 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.3 
 
 		 579 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.95 
 
 		 169 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  38.22 
 
 		 183 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  31.61 
 
 		 171 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  38.16 
 
 		 179 aa  89.7  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  36.53 
 
 		 171 aa  89.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  34.67 
 
 		 219 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  36.42 
 
 		 168 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  37.97 
 
 		 171 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  34.93 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  38.56 
 
 		 177 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  34.73 
 
 		 173 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  36.42 
 
 		 186 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  32.54 
 
 		 177 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  35.66 
 
 		 200 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  33.55 
 
 		 192 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  38.3 
 
 		 190 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  33.33 
 
 		 173 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  29.24 
 
 		 181 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  35.66 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  35.71 
 
 		 191 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  34.73 
 
 		 173 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  34.73 
 
 		 173 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  34.73 
 
 		 173 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  35.62 
 
 		 180 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  37.06 
 
 		 206 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  33.96 
 
 		 190 aa  86.3  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  35.1 
 
 		 186 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  33.72 
 
 		 198 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  37.32 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  39.04 
 
 		 237 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  35.8 
 
 		 170 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  37.32 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>