More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2488 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  43.66 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  38.82 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  39.08 
 
 		 591 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  40 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  41.21 
 
 		 191 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  40.99 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  38.04 
 
 		 181 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  37.65 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  38.12 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  43.4 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  37.04 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  33.75 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  38.27 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 		 593 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  38.51 
 
 		 200 aa  99  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  42.5 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  36.65 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  36.81 
 
 		 180 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0395  shikimate kinase  42.33 
 
 		 214 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  37.58 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  39.88 
 
 		 224 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  38.75 
 
 		 199 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  38.12 
 
 		 192 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  36.25 
 
 		 219 aa  95.5  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  36.81 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  40.13 
 
 		 519 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  36.81 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  36.84 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  34.3 
 
 		 200 aa  94.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  37.27 
 
 		 201 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  35.4 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  34.3 
 
 		 217 aa  94.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  35.4 
 
 		 181 aa  94  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.22 
 
 		 539 aa  94  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 579 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 604 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  35.71 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  36.26 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  35.71 
 
 		 196 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  38.36 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  39.87 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  39.51 
 
 		 235 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  39.51 
 
 		 235 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  39.51 
 
 		 235 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 		 579 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  38.41 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  36.36 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  35.67 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  34.34 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  38.51 
 
 		 220 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  37.27 
 
 		 180 aa  90.9  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  33.73 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  35.67 
 
 		 171 aa  90.5  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  40.13 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  36.81 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  40.25 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3137  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.42 
 
 		 310 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  34.57 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  36.31 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  39.51 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  40.38 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  35.76 
 
 		 552 aa  89  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  38.41 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  38.36 
 
 		 207 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  39.49 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  37.35 
 
 		 220 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  33.74 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  40.94 
 
 		 190 aa  88.2  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  38.27 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  33.14 
 
 		 180 aa  87.8  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  33.76 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  33.75 
 
 		 206 aa  87.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  36.9 
 
 		 192 aa  87.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  34.73 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  35.8 
 
 		 168 aa  87.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  37.27 
 
 		 175 aa  87  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  36.71 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  40.74 
 
 		 615 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  33.79 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  40.88 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  36.88 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  36.25 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1388  Shikimate kinase  39.71 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00592582  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  35.58 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  37.27 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  34.73 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  33.54 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  36.08 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  35.67 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  38.73 
 
 		 237 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.14 
 
 		 294 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  33.75 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  30.54 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  37.04 
 
 		 204 aa  84.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  37.76 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  33.54 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  32.52 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.97 
 
 		 184 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  34.16 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>