More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0696 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  100 
 
 		 163 aa  336  8e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0631  shikimate kinase  57.14 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0688988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  40.37 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  36.71 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  37.8 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  40.88 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1906  shikimate kinase  40.37 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  38.27 
 
 		 454 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 539 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  35.22 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  39.24 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  40.79 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  40.4 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  38.51 
 
 		 179 aa  97.4  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  38.41 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  38.51 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  36.36 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  36.36 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  40 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  35.85 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  35.85 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  36.14 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  36.02 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  33.74 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  37.27 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  35.22 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  37.84 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  34.57 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  37.34 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  38.51 
 
 		 200 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  33.13 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  37.35 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  37.01 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  37.97 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  36.65 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  34.16 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  36.65 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  37.97 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  36.31 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  37.97 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  36.2 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  33.75 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  37.84 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  35.06 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  37.35 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  34.78 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  36.48 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  37.01 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  34.19 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  37.16 
 
 		 196 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  33.95 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  33.95 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  35.03 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  31.4 
 
 		 188 aa  87.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  34.55 
 
 		 172 aa  87.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  36.71 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  36.71 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  33.33 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  31.52 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  36.42 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  36.65 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  36.14 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  37.89 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  37.16 
 
 		 192 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  36.48 
 
 		 203 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  36.65 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  34.84 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  34.78 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  36.65 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  36.65 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  33.12 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  37.34 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  33.54 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  36.42 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  35.76 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  37.14 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  34.13 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  34.16 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  35.8 
 
 		 189 aa  85.1  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  37.34 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  35.1 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  34.78 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  32.68 
 
 		 197 aa  84.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  34.16 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  38.13 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  36.65 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  31.85 
 
 		 197 aa  84  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  36.42 
 
 		 199 aa  84  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  36.6 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  35.93 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  34.16 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  36.42 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  35.21 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  35.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  35.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  35.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  34.81 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  35.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 		 604 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  35.81 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>