More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4091 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  42.31 
 
 		 840 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  45.55 
 
 		 1048 aa  902    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  45.96 
 
 		 1054 aa  998    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  63.14 
 
 		 1073 aa  1378    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  63.05 
 
 		 1067 aa  1372    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  56.94 
 
 		 1065 aa  1251    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  41.41 
 
 		 1065 aa  852    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 1060 aa  2187    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  57.86 
 
 		 1056 aa  1249    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  56.87 
 
 		 1055 aa  1227    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 		 1061 aa  973    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  61.14 
 
 		 1102 aa  1357    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  53.92 
 
 		 961 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  54.06 
 
 		 1004 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  52.57 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  52.32 
 
 		 968 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  49.65 
 
 		 938 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  50.63 
 
 		 983 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  49.88 
 
 		 980 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 984 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  50 
 
 		 984 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  48.13 
 
 		 973 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  51.15 
 
 		 962 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  49.88 
 
 		 980 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 940 aa  353  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  46.31 
 
 		 840 aa  352  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 		 964 aa  347  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 746 aa  309  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  40.89 
 
 		 540 aa  278  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 		 524 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  37.2 
 
 		 528 aa  258  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 542 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 796 aa  239  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  43.87 
 
 		 270 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 568 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 691 aa  154  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  50.98 
 
 		 711 aa  149  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  52.82 
 
 		 576 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 544 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  69.79 
 
 		 102 aa  144  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 2654 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 1165 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 1574 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  29.22 
 
 		 2035 aa  111  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.12 
 
 		 2213 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  42.97 
 
 		 539 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 		 560 aa  104  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  27.6 
 
 		 923 aa  102  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 1410 aa  101  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 		 686 aa  102  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 893 aa  100  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 1788 aa  97.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.66 
 
 		 778 aa  97.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.95 
 
 		 775 aa  97.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.28 
 
 		 1247 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1251 aa  94  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 940 aa  93.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  25.2 
 
 		 935 aa  92.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 955 aa  92  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1214 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.28 
 
 		 1247 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  23.87 
 
 		 1247 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.46 
 
 		 1247 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 589 aa  88.2  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.46 
 
 		 1248 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.63 
 
 		 1237 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1245 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 1109 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  28.81 
 
 		 1215 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 626 aa  84.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  28.34 
 
 		 1212 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  23.9 
 
 		 714 aa  82.8  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 		 946 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  23.87 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 937 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  24.38 
 
 		 1206 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  30.21 
 
 		 1065 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 342 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.17 
 
 		 1069 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 		 1194 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.5 
 
 		 818 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  25.31 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.98 
 
 		 768 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  23.97 
 
 		 751 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.11 
 
 		 1244 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  24.79 
 
 		 934 aa  77  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 		 347 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 1255 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  36.84 
 
 		 760 aa  77  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 937 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 703 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2961  GGDEF domain-containing protein  27.7 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0857681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  24.87 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.9 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 		 654 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 		 636 aa  75.5  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  33.77 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>