More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3667 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  61.09 
 
 		 1060 aa  1375    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  45.98 
 
 		 1054 aa  1003    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  58.96 
 
 		 1065 aa  1346    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 		 1061 aa  964    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  80.04 
 
 		 1067 aa  1812    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 1102 aa  2267    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  43.51 
 
 		 1048 aa  865    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  78.7 
 
 		 1073 aa  1798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  43.07 
 
 		 840 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  57.29 
 
 		 1056 aa  1288    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  56.49 
 
 		 1055 aa  1242    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 		 1065 aa  863    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  52.15 
 
 		 1004 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  53.9 
 
 		 961 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  51.31 
 
 		 938 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  50.48 
 
 		 796 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  46.17 
 
 		 968 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  52.42 
 
 		 983 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  52.28 
 
 		 962 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  49.28 
 
 		 984 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  48.87 
 
 		 980 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  49.28 
 
 		 984 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  51.01 
 
 		 980 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  48.72 
 
 		 973 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  48.21 
 
 		 840 aa  349  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 		 940 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  45.29 
 
 		 964 aa  334  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 746 aa  294  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  40.84 
 
 		 540 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  39.95 
 
 		 524 aa  264  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 542 aa  242  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 796 aa  234  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  35.88 
 
 		 528 aa  218  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  45 
 
 		 270 aa  214  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 		 568 aa  194  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 515 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 		 539 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  55.91 
 
 		 711 aa  153  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  65.69 
 
 		 102 aa  147  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 576 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 		 686 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 560 aa  128  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  44.88 
 
 		 691 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.29 
 
 		 2035 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 		 2654 aa  115  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.69 
 
 		 2213 aa  110  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 1251 aa  101  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 		 1788 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 1165 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  22.45 
 
 		 1574 aa  92  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1214 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  21.89 
 
 		 935 aa  90.1  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.24 
 
 		 768 aa  89  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 1410 aa  86.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1237 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  23.73 
 
 		 923 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.57 
 
 		 424 aa  86.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 931 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 946 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.2 
 
 		 778 aa  83.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.89 
 
 		 893 aa  84  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.59 
 
 		 794 aa  83.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  24.9 
 
 		 934 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  24.7 
 
 		 474 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 		 726 aa  80.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.73 
 
 		 1244 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  25.09 
 
 		 932 aa  79  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.72 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  21.89 
 
 		 775 aa  76.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  24.63 
 
 		 714 aa  77  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 		 1069 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 703 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 		 268 aa  74.3  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.41 
 
 		 1210 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 703 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  36.22 
 
 		 384 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  23.41 
 
 		 1211 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 654 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1245 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.62 
 
 		 1248 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  23.67 
 
 		 751 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  23.4 
 
 		 1065 aa  72  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 382 aa  72  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.25 
 
 		 1247 aa  71.6  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 456 aa  71.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 348 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 		 400 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3396  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 376 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.759703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  33.93 
 
 		 421 aa  71.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 422 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 		 539 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>