More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02406 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  54.31 
 
 		 840 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  100 
 
 		 1048 aa  2162    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  41.19 
 
 		 1065 aa  837    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 		 1061 aa  744    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 		 1060 aa  938    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  45.16 
 
 		 1056 aa  914    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  45.32 
 
 		 1067 aa  904    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 		 1102 aa  888    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  42.79 
 
 		 1055 aa  867    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  44.08 
 
 		 1073 aa  904    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  42.87 
 
 		 1065 aa  878    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  48.62 
 
 		 1054 aa  994    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  53.28 
 
 		 938 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  51.02 
 
 		 1004 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  49.88 
 
 		 961 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  48.44 
 
 		 796 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  48.44 
 
 		 968 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  50.6 
 
 		 983 aa  406  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  49.52 
 
 		 984 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  49.52 
 
 		 984 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  47.38 
 
 		 973 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  50.64 
 
 		 980 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  49.49 
 
 		 962 aa  383  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  47.98 
 
 		 980 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  46.59 
 
 		 964 aa  357  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  44.64 
 
 		 940 aa  354  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  46.45 
 
 		 840 aa  354  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  43.67 
 
 		 746 aa  304  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  39.04 
 
 		 540 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  41.05 
 
 		 528 aa  265  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  37.05 
 
 		 796 aa  244  7.999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 524 aa  243  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  37.47 
 
 		 542 aa  240  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  46.88 
 
 		 270 aa  225  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 		 568 aa  214  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 515 aa  171  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 691 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  153  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 544 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  52.31 
 
 		 711 aa  146  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 		 539 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 686 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02404  hypothetical protein  41.84 
 
 		 122 aa  93.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 560 aa  92.8  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  26.22 
 
 		 2035 aa  81.3  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 1490 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 		 1480 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.03 
 
 		 1410 aa  77  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 1574 aa  76.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  23.69 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.92 
 
 		 268 aa  73.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 539 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  37.5 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 		 160 aa  71.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 		 269 aa  71.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  21.92 
 
 		 922 aa  70.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  25.29 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2713  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.409072  decreased coverage  0.0000724221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.6 
 
 		 1244 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  26.84 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.8 
 
 		 2213 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 351 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 363 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 327 aa  67.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.45 
 
 		 390 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 328 aa  67.4  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  51.61 
 
 		 461 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  32.84 
 
 		 329 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  51.61 
 
 		 461 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.77 
 
 		 868 aa  67  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 339 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  33.94 
 
 		 421 aa  66.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3396  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.759703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 		 692 aa  66.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.76 
 
 		 1248 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.11 
 
 		 1165 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  37.04 
 
 		 787 aa  65.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  34.01 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>