More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0337 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 515 aa  1065    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  41.75 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  42.28 
 
 		 746 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  42.52 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  37.94 
 
 		 542 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  37.5 
 
 		 528 aa  343  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 1004 aa  333  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 		 686 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  35.6 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 691 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 544 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 560 aa  280  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  26.38 
 
 		 984 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 984 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 		 940 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  31.15 
 
 		 973 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  28.51 
 
 		 840 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 964 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 796 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 961 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 1067 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 1060 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  31.27 
 
 		 1054 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 968 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 938 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 980 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 1056 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 1055 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 1102 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 962 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 1065 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.02 
 
 		 980 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 1065 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1048 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 1061 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 419 aa  143  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 418 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 1073 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.97 
 
 		 792 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  37.58 
 
 		 270 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 		 983 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  31.95 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  32.98 
 
 		 304 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  46.53 
 
 		 1171 aa  97.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 371 aa  97.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 571 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2012  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.55 
 
 		 531 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0999069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  25.7 
 
 		 840 aa  93.6  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.42 
 
 		 351 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  46.53 
 
 		 269 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 		 268 aa  90.1  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  43.14 
 
 		 518 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  46 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  46.32 
 
 		 247 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  48.42 
 
 		 636 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  25.72 
 
 		 574 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3396  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 376 aa  87.4  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.759703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1204  metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 		 553 aa  87.4  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.06 
 
 		 491 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3786  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.48 
 
 		 529 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 		 1335 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  45.26 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 		 212 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  44.9 
 
 		 740 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  45.26 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1002  metal dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  30.34 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  45.83 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  42.57 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  47.06 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  44.79 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0737  metal dependent phosphohydrolase  44.33 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  45.26 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 403 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.32 
 
 		 363 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  24.09 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>