More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3620 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  100 
 
 		 540 aa  1122    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  53.28 
 
 		 528 aa  551  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  47.74 
 
 		 746 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  46.72 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  43.47 
 
 		 524 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 		 1004 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 		 576 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  39.96 
 
 		 796 aa  369  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  42.95 
 
 		 840 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  35.6 
 
 		 515 aa  321  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 983 aa  317  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 		 968 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  39.46 
 
 		 980 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 984 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  38.05 
 
 		 984 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 796 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  38.64 
 
 		 973 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 		 964 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 962 aa  300  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 		 961 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 		 1056 aa  292  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  40.84 
 
 		 1102 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  40.26 
 
 		 1073 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  40.89 
 
 		 1060 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  41.73 
 
 		 1055 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  39.07 
 
 		 1065 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 940 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  38.9 
 
 		 1067 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  38.8 
 
 		 1054 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 980 aa  256  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1048 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 691 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 		 1065 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 539 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 		 1061 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 686 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 544 aa  237  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  40.5 
 
 		 270 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  56.05 
 
 		 938 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  36.2 
 
 		 840 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  41.41 
 
 		 711 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.34 
 
 		 792 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  51.65 
 
 		 102 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  25 
 
 		 417 aa  89.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 		 413 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 		 424 aa  87.8  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.52 
 
 		 636 aa  87.8  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  38.53 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  38.53 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 654 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 		 740 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  34.27 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  38.84 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  44.83 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 363 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 		 400 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 619 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 382 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  29.69 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  35.14 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  37.5 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 1171 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  34.69 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.53 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  37.72 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.12 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.18 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>