25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0883 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  39.73 
 
 		 746 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  40.31 
 
 		 528 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 568 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 796 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 542 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 576 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.63 
 
 		 792 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 1004 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  29.69 
 
 		 540 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 		 686 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 544 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 		 691 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 539 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.65 
 
 		 612 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1998  hypothetical protein  36.64 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  27.96 
 
 		 794 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1840  GAF domain protein  20.42 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 602 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>