More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2177 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
576 aa  1176    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  54.84 
 
 
568 aa  597  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  45.25 
 
 
746 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  44.8 
 
 
796 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  44.91 
 
 
528 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
515 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  43.54 
 
 
524 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  37.52 
 
 
1004 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  38.81 
 
 
540 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  41.14 
 
 
542 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
544 aa  292  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 
686 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 
962 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  32.92 
 
 
560 aa  280  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
691 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 
983 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.45 
 
 
980 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
984 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  30.86 
 
 
984 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 
539 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
968 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
964 aa  270  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  37.14 
 
 
973 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  38.11 
 
 
961 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
796 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  40.05 
 
 
1055 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
938 aa  249  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
1056 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  34.68 
 
 
1054 aa  242  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
1073 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
980 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 
1061 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
1065 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  32.18 
 
 
840 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
1065 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
1067 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  35.05 
 
 
1048 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  52.82 
 
 
1060 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  43.29 
 
 
940 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  33.92 
 
 
840 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
1102 aa  144  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  44.44 
 
 
270 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 
419 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  40 
 
 
711 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
415 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.28 
 
 
792 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 
371 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  49.12 
 
 
636 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 
424 aa  101  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
635 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  32.29 
 
 
304 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 
574 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
373 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  45.22 
 
 
760 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
654 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 
160 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
571 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  26.22 
 
 
417 aa  88.6  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
647 aa  87  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  31.77 
 
 
422 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 
545 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.63 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  44.74 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  52.33 
 
 
102 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  42.48 
 
 
339 aa  84  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
420 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 
565 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  28.72 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.36 
 
 
268 aa  82.8  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
353 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
338 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
338 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3086  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
421 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.688804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3096  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
421 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 
710 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1281  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.246487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 
491 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  37.84 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3239  metal dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.36 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2799  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1387  HD domain-containing protein  39.68 
 
 
422 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  31.96 
 
 
350 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2017  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
379 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 
338 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>