More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2026 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
568 aa  1169    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  54.84 
 
 
576 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  44.99 
 
 
796 aa  444  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  44.92 
 
 
746 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  41.75 
 
 
515 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  42.94 
 
 
528 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
1004 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  38.59 
 
 
540 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 
542 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
691 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
686 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
544 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
539 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 
560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
938 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
983 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  34.02 
 
 
973 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  28.4 
 
 
984 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 
984 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  31.56 
 
 
840 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  37.47 
 
 
1056 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 
961 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
1065 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
1060 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  35.11 
 
 
1054 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
940 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
1073 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  34.65 
 
 
1048 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
1102 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
968 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
1055 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  49.63 
 
 
964 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 
796 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 
980 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
962 aa  134  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  47.79 
 
 
980 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  44.06 
 
 
1065 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 
419 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  41.73 
 
 
270 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
418 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
1067 aa  127  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
1061 aa  126  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  33.09 
 
 
840 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35 
 
 
792 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  40.24 
 
 
711 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
415 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  50.81 
 
 
636 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
571 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
366 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
371 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  45.74 
 
 
635 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  49.21 
 
 
760 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  32.21 
 
 
417 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
574 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  33.51 
 
 
304 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 
647 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
654 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 
647 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
373 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  29.7 
 
 
550 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.9 
 
 
353 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1355  metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
391 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 
424 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 
196 aa  90.1  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
350 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  42.98 
 
 
417 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 
450 aa  89  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
545 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  40.5 
 
 
431 aa  88.2  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
448 aa  87.8  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
565 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3786  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 
529 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 
359 aa  87  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
339 aa  87  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
343 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
343 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  48.45 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.74 
 
 
346 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.35 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  42.98 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2012  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.12 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0999069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  39.26 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  44.35 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  53.42 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  44.74 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  41.38 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  41.74 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.26 
 
 
853 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
710 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.35 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  41.84 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  42.62 
 
 
358 aa  84  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  54.79 
 
 
403 aa  84  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>