More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0428 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  45.98 
 
 		 1102 aa  990    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 		 1067 aa  980    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  46.48 
 
 		 1065 aa  988    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  44.38 
 
 		 1056 aa  954    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  44.11 
 
 		 840 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  42 
 
 		 1065 aa  858    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  48.62 
 
 		 1048 aa  960    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 		 1073 aa  993    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 		 1061 aa  851    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  45.96 
 
 		 1060 aa  998    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 		 1055 aa  939    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  100 
 
 		 1054 aa  2172    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  52.82 
 
 		 1004 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  48.06 
 
 		 938 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  47.01 
 
 		 961 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  46.56 
 
 		 796 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  48.54 
 
 		 984 aa  380  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  48.54 
 
 		 984 aa  380  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  45.89 
 
 		 968 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 962 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  47.84 
 
 		 980 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  48.31 
 
 		 983 aa  360  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  46.63 
 
 		 973 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  41.81 
 
 		 980 aa  353  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  46.53 
 
 		 964 aa  347  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 940 aa  346  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  45.1 
 
 		 840 aa  337  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  44.82 
 
 		 746 aa  310  9e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  38.8 
 
 		 540 aa  260  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 576 aa  242  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  38.1 
 
 		 528 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 		 796 aa  214  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  43.75 
 
 		 270 aa  209  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 542 aa  205  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 568 aa  205  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 		 515 aa  179  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 691 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 544 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  66.67 
 
 		 102 aa  141  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  48.15 
 
 		 711 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 686 aa  128  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  23.86 
 
 		 1574 aa  106  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 560 aa  100  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.05 
 
 		 2654 aa  97.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.85 
 
 		 2213 aa  93.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  22.05 
 
 		 893 aa  90.9  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  22.61 
 
 		 2035 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 		 598 aa  86.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 		 589 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  24.51 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 		 1165 aa  85.1  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 626 aa  83.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  19.69 
 
 		 935 aa  82  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  22.17 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  23.53 
 
 		 934 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.61 
 
 		 1788 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  20.58 
 
 		 775 aa  81.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 1109 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  22.99 
 
 		 489 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.85 
 
 		 1410 aa  80.1  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  23.7 
 
 		 1418 aa  80.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  21.19 
 
 		 923 aa  79  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.67 
 
 		 1244 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.13 
 
 		 812 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  21.4 
 
 		 1247 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.4 
 
 		 1247 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  23.61 
 
 		 507 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  23.61 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  23.18 
 
 		 507 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.99 
 
 		 1247 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.72 
 
 		 818 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  20.67 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 932 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3519  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.39 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 955 aa  73.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.46 
 
 		 1490 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2961  GGDEF domain-containing protein  23.33 
 
 		 204 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0857681  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  26.01 
 
 		 688 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  22.75 
 
 		 483 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 422 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 710 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  22.27 
 
 		 778 aa  73.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.67 
 
 		 1247 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.46 
 
 		 1480 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 539 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  22.32 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 		 726 aa  73.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 937 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  22.75 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  33.93 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  41.49 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 		 448 aa  72  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  21.1 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  20.58 
 
 		 932 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>