More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0133 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 524 aa  1086    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  47.57 
 
 		 746 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  47.98 
 
 		 528 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  46.14 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  43.47 
 
 		 540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  43.54 
 
 		 576 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 		 796 aa  391  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 		 515 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 		 983 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 962 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  40.58 
 
 		 980 aa  293  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  38.95 
 
 		 973 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  37.33 
 
 		 984 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 984 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  38.63 
 
 		 961 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 		 980 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 938 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 		 796 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 		 686 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 968 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 964 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  39.95 
 
 		 1067 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  39.95 
 
 		 1102 aa  264  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  39.24 
 
 		 840 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 		 1060 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  42.18 
 
 		 1004 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 1073 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 		 691 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 539 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 		 1055 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 		 1065 aa  246  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 		 940 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 1056 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1048 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  31.63 
 
 		 1054 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  54.36 
 
 		 1061 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  54.93 
 
 		 270 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  51.7 
 
 		 1065 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  33.92 
 
 		 840 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  42.07 
 
 		 711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 418 aa  123  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.73 
 
 		 792 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  34.78 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 574 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  30.04 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  37.72 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  37.17 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  38.94 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  39.17 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  36.43 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  38.79 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 306 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2012  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0999069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  41.23 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1983  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.74 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00722808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  36.7 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  36.52 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  37.17 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>