More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3976 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  38.58 
 
 		 984 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 984 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  65.28 
 
 		 983 aa  1206    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  100 
 
 		 980 aa  1995    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 		 961 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 968 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  43.54 
 
 		 973 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  38.31 
 
 		 962 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 		 980 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  43.95 
 
 		 796 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 964 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 		 938 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 		 940 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 1004 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  38.79 
 
 		 840 aa  426  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  51.78 
 
 		 1067 aa  406  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  53.09 
 
 		 1056 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  50.37 
 
 		 1060 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  51.13 
 
 		 1055 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  52.06 
 
 		 1065 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  49.77 
 
 		 1061 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  51.01 
 
 		 1102 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  49.02 
 
 		 1073 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  51.31 
 
 		 1048 aa  379  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  47.84 
 
 		 1054 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  44.55 
 
 		 1065 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  32.36 
 
 		 711 aa  338  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  37.63 
 
 		 528 aa  332  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  41.81 
 
 		 746 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  39.46 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  40.58 
 
 		 524 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 576 aa  280  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  55.37 
 
 		 270 aa  277  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 542 aa  275  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  50.17 
 
 		 840 aa  267  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 796 aa  234  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 515 aa  165  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 691 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 539 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 544 aa  155  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  47.79 
 
 		 568 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  27.38 
 
 		 712 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  59.34 
 
 		 102 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 724 aa  107  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  41.73 
 
 		 686 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  24.23 
 
 		 651 aa  105  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.47 
 
 		 637 aa  99.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  23.02 
 
 		 643 aa  98.6  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 		 636 aa  91.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 422 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 425 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 		 422 aa  89  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  39.66 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 424 aa  84  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  45.12 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  39.47 
 
 		 389 aa  80.9  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 647 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 		 431 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 399 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 647 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  35 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  48.91 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  37.5 
 
 		 419 aa  77  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  46.99 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.47 
 
 		 1171 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  41.05 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1789  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101023  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  50.77 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  50.77 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 319 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 393 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  39.52 
 
 		 427 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 351 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.17 
 
 		 760 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  46.59 
 
 		 419 aa  74.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 		 648 aa  73.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  41.82 
 
 		 460 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 420 aa  73.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 347 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.03 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>