More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0250 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
980 aa  1991    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  50.68 
 
 
796 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  50.26 
 
 
961 aa  922    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  50.16 
 
 
968 aa  912    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 
938 aa  720    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
983 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  39.19 
 
 
973 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  40.62 
 
 
980 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
962 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
984 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  32.52 
 
 
984 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  33.23 
 
 
1004 aa  515  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
964 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
940 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  49.88 
 
 
1060 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  36.95 
 
 
840 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  48.87 
 
 
1102 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  49.24 
 
 
1067 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  46.98 
 
 
1073 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  48.8 
 
 
1055 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
1056 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  47.51 
 
 
1065 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  46.09 
 
 
1065 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  49.51 
 
 
1061 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  48.34 
 
 
1048 aa  362  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  41.81 
 
 
1054 aa  353  7e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
746 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  34.86 
 
 
528 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  29.05 
 
 
711 aa  287  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  36.45 
 
 
540 aa  283  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  35.7 
 
 
524 aa  281  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
542 aa  267  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  45.7 
 
 
840 aa  259  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  48.68 
 
 
270 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
576 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
796 aa  213  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
515 aa  177  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 
544 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 
539 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 
568 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  45.67 
 
 
691 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  25.3 
 
 
726 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 
560 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
686 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 
651 aa  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  24.89 
 
 
643 aa  105  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.41 
 
 
637 aa  104  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  22.62 
 
 
702 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  52.08 
 
 
102 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3823  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 
354 aa  94  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.85 
 
 
636 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 
1171 aa  92  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  45.61 
 
 
419 aa  90.9  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 
399 aa  89  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  50.62 
 
 
431 aa  88.6  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  24.14 
 
 
724 aa  84.7  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 
269 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  41.67 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  39.33 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
348 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
647 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  39.47 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  50.6 
 
 
1237 aa  81.3  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  41.23 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
647 aa  81.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.31 
 
 
701 aa  80.9  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
351 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 
491 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
363 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 
512 aa  80.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
403 aa  79.7  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 
424 aa  79  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  41.96 
 
 
434 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 
363 aa  79  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
635 aa  79  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 
389 aa  79  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  41.07 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.47 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.74 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3915  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  34.42 
 
 
329 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
418 aa  77.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  47.5 
 
 
361 aa  77.4  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  34.59 
 
 
340 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  37.31 
 
 
356 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  46.51 
 
 
344 aa  77  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
353 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0737  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>