More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02399 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  65.69 
 
 		 1102 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  66.34 
 
 		 1067 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  69.79 
 
 		 1060 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  68.04 
 
 		 1073 aa  142  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  66.67 
 
 		 1054 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  70.21 
 
 		 1055 aa  139  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  62.24 
 
 		 1065 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  67.02 
 
 		 1056 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  71.43 
 
 		 1048 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  64.58 
 
 		 1065 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  56.25 
 
 		 1061 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  59.34 
 
 		 980 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  53.26 
 
 		 940 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  57.14 
 
 		 524 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  53.61 
 
 		 964 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  55.21 
 
 		 1004 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  55.43 
 
 		 961 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  51.65 
 
 		 540 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  52.08 
 
 		 796 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  53.68 
 
 		 973 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  54.95 
 
 		 968 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  52.08 
 
 		 980 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  51.04 
 
 		 840 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  54.35 
 
 		 746 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  51.61 
 
 		 983 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  51.65 
 
 		 938 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  50 
 
 		 984 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 984 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  52.08 
 
 		 962 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  47.78 
 
 		 796 aa  91.3  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  51.16 
 
 		 270 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  52.33 
 
 		 576 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  46.59 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  47.25 
 
 		 542 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  51.35 
 
 		 691 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  45.98 
 
 		 568 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  44.59 
 
 		 515 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 		 544 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  44.3 
 
 		 539 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 		 686 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  48.53 
 
 		 539 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 		 703 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  54.9 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  43.59 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.27 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.97 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  54.9 
 
 		 461 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.39 
 
 		 367 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 		 346 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  43.28 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  57.78 
 
 		 710 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2004  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0562345  hitchhiker  0.000000282251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1971  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0825869  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  58.54 
 
 		 364 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  56.52 
 
 		 692 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 		 416 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.04 
 
 		 491 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  48.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 		 424 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  42.25 
 
 		 390 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 331 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 331 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 363 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  52.17 
 
 		 712 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  44.78 
 
 		 340 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 		 492 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  46.38 
 
 		 525 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  58.97 
 
 		 344 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 		 306 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  45.1 
 
 		 431 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 331 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 		 448 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 		 428 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  39.13 
 
 		 424 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  37.68 
 
 		 425 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  37.68 
 
 		 422 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3396  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 376 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.759703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 452 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.89 
 
 		 333 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2105  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 		 525 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173233  normal  0.407049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  45.9 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  41.1 
 
 		 1171 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 		 363 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 421 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 371 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 650 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 		 451 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  41.18 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  40.58 
 
 		 363 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.78 
 
 		 343 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  53.19 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1663  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 375 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.860701  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 		 428 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  47.06 
 
 		 460 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 328 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>