More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3006 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  40.06 
 
 		 980 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  38.7 
 
 		 984 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  65.28 
 
 		 980 aa  1186    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  44.04 
 
 		 973 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  38.7 
 
 		 984 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 983 aa  1994    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 968 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 		 961 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 962 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 938 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 		 964 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  43.05 
 
 		 796 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 		 940 aa  532  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 1004 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  38.09 
 
 		 840 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  51.12 
 
 		 1060 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  51.75 
 
 		 1067 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  53.35 
 
 		 1102 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  54.03 
 
 		 1065 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  52.84 
 
 		 1048 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  52.99 
 
 		 1056 aa  396  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  51.69 
 
 		 1055 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  50.77 
 
 		 1073 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  52.43 
 
 		 1061 aa  386  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  39.21 
 
 		 746 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  45.91 
 
 		 1065 aa  365  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  48.31 
 
 		 1054 aa  364  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  40.31 
 
 		 528 aa  350  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  32.87 
 
 		 711 aa  328  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 		 524 aa  320  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 542 aa  297  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  56.87 
 
 		 270 aa  297  8e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  33.73 
 
 		 540 aa  283  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  33.28 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  50.53 
 
 		 840 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 796 aa  252  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 		 568 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 691 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  25.04 
 
 		 544 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 686 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  26.21 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  28.31 
 
 		 651 aa  104  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 		 712 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  51.61 
 
 		 102 aa  99.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 724 aa  98.2  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 560 aa  97.8  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.82 
 
 		 637 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  22.75 
 
 		 643 aa  88.2  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 425 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 422 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  43.2 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  40.71 
 
 		 422 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 635 aa  84  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  41.23 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  22.04 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 434 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 		 359 aa  80.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  42.24 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  37.88 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  42.15 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  41.23 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  50.65 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  36.21 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 		 392 aa  77.4  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  40.34 
 
 		 427 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 		 512 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  26.91 
 
 		 1439 aa  76.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 431 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.6 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.25 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  50.63 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  39.37 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  50.63 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  38.66 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  24.3 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  38.66 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.39 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.91 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  43.48 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.09 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.6 
 
 		 1171 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>