More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2304 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
691 aa  1395    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  44.34 
 
 
686 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 
544 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  39.96 
 
 
539 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  39.07 
 
 
560 aa  348  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
796 aa  296  8e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
576 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
542 aa  263  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  34.24 
 
 
528 aa  263  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 
746 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  31.85 
 
 
540 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 
524 aa  249  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
1004 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  33.55 
 
 
973 aa  181  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  24.89 
 
 
984 aa  177  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  24.89 
 
 
984 aa  177  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 
964 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
983 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.32 
 
 
980 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
940 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
1056 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 
796 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
1060 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  29.44 
 
 
1054 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  28.36 
 
 
840 aa  153  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
962 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 
961 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
1067 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  30.88 
 
 
1048 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  35.31 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
418 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
1065 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 
1073 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  44.88 
 
 
938 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  47.24 
 
 
1055 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  45.67 
 
 
980 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  44.88 
 
 
1102 aa  123  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  39.37 
 
 
1065 aa  122  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
415 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.34 
 
 
366 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 
1061 aa  120  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  40.62 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  45.67 
 
 
968 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  32.37 
 
 
417 aa  117  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
371 aa  117  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 
719 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
636 aa  99.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 
343 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 
343 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  42.48 
 
 
431 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  27.52 
 
 
571 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
710 aa  91.3  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 
703 aa  90.9  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 
461 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 
692 aa  90.9  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 
461 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 
574 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  32.93 
 
 
712 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  24.58 
 
 
703 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
654 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
363 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 
436 aa  88.6  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
268 aa  88.6  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 
392 aa  87.8  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  43.69 
 
 
347 aa  87.4  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
373 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  44.55 
 
 
635 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3396  response regulator receiver protein  43.24 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.759703  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  41.35 
 
 
760 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.78 
 
 
792 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.18 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
353 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
328 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  43.36 
 
 
327 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
328 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
353 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  41.58 
 
 
647 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  30.57 
 
 
414 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 
1171 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  44.55 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.42 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  27.72 
 
 
550 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  42.11 
 
 
460 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  40 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
348 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.51 
 
 
363 aa  80.5  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
364 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
417 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
390 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 
420 aa  80.1  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
864 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>