More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0537 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  45.16 
 
 		 1048 aa  886    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  44.38 
 
 		 1054 aa  954    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 		 1061 aa  943    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  58.65 
 
 		 1067 aa  1269    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  57.86 
 
 		 1060 aa  1249    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  43.33 
 
 		 840 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  57.29 
 
 		 1102 aa  1274    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 		 1065 aa  832    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  57.82 
 
 		 1073 aa  1254    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  68.71 
 
 		 1055 aa  1520    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  55.56 
 
 		 1065 aa  1188    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 1056 aa  2166    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  54.45 
 
 		 1004 aa  439  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  52.63 
 
 		 961 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  52.52 
 
 		 796 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  52.91 
 
 		 968 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  51.17 
 
 		 938 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  49.12 
 
 		 973 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  51.3 
 
 		 984 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  51.3 
 
 		 984 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 980 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  53.09 
 
 		 980 aa  386  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  51.81 
 
 		 983 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  50.52 
 
 		 962 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  50.26 
 
 		 840 aa  373  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  47.04 
 
 		 940 aa  353  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  48.31 
 
 		 964 aa  343  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  47.94 
 
 		 746 aa  324  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  43.12 
 
 		 540 aa  292  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  40.9 
 
 		 528 aa  254  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 576 aa  249  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 524 aa  244  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 		 542 aa  243  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  47.6 
 
 		 270 aa  229  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  37.47 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 		 796 aa  206  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 515 aa  176  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 539 aa  162  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 691 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 		 544 aa  145  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  56.2 
 
 		 711 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  67.02 
 
 		 102 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.34 
 
 		 2035 aa  131  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 1574 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  26.74 
 
 		 893 aa  110  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.13 
 
 		 2213 aa  108  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  38.28 
 
 		 560 aa  98.6  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.87 
 
 		 2654 aa  98.2  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 		 1788 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.42 
 
 		 1248 aa  95.1  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 686 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 		 1165 aa  94  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 934 aa  93.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1410 aa  93.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 589 aa  91.3  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 		 940 aa  90.1  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 932 aa  89  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  24.32 
 
 		 923 aa  89  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  24.71 
 
 		 935 aa  88.2  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 818 aa  87.8  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.21 
 
 		 1244 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1245 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  25 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  22.26 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 		 1214 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 1237 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  22.5 
 
 		 778 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 		 812 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.13 
 
 		 1194 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.22 
 
 		 1247 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1642  putative PAS/PAC sensor protein  23.43 
 
 		 796 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0928458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  21.81 
 
 		 1247 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  26.34 
 
 		 937 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  26.86 
 
 		 714 aa  80.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  24.52 
 
 		 931 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.4 
 
 		 1247 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.49 
 
 		 1069 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  27.35 
 
 		 928 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  27.35 
 
 		 928 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  27.35 
 
 		 928 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 626 aa  77.8  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  25.28 
 
 		 751 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  25.28 
 
 		 1206 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  35.96 
 
 		 760 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  32.45 
 
 		 596 aa  77  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 342 aa  77  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  26.27 
 
 		 912 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  25.49 
 
 		 922 aa  76.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 937 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.4 
 
 		 1247 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.3 
 
 		 768 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  30.61 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  23.85 
 
 		 830 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 		 726 aa  75.5  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  23.95 
 
 		 830 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  23.46 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>