More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3248 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 		 983 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  84.5 
 
 		 796 aa  1330    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  45.66 
 
 		 938 aa  797    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 961 aa  1942    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  42.42 
 
 		 980 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  84.67 
 
 		 968 aa  1595    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  50.68 
 
 		 980 aa  929    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  38.97 
 
 		 973 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 		 962 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 1004 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 984 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  33.81 
 
 		 984 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  36.64 
 
 		 964 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 		 940 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  53.92 
 
 		 1060 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  52.63 
 
 		 1056 aa  436  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  53.79 
 
 		 1067 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  53.87 
 
 		 1055 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  53.9 
 
 		 1102 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  38.39 
 
 		 840 aa  426  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  51.31 
 
 		 1065 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  51.7 
 
 		 1073 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  47.98 
 
 		 1065 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  48.08 
 
 		 1061 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  51.41 
 
 		 1048 aa  393  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  47.01 
 
 		 1054 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  37.32 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  48.8 
 
 		 840 aa  278  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  29.02 
 
 		 711 aa  266  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 576 aa  266  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  51.41 
 
 		 270 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 568 aa  222  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  44.7 
 
 		 528 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 515 aa  190  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 		 746 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 686 aa  168  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  47.97 
 
 		 796 aa  160  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 691 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  51.39 
 
 		 542 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2598  hypothetical protein  81.37 
 
 		 115 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146267  normal  0.0658488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  25.61 
 
 		 726 aa  125  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  24.81 
 
 		 702 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 560 aa  104  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  55.43 
 
 		 102 aa  102  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  25.06 
 
 		 724 aa  101  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 544 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  26.68 
 
 		 651 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.08 
 
 		 637 aa  95.9  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  22.53 
 
 		 643 aa  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 636 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  34.9 
 
 		 760 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 768 aa  78.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 654 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  38.84 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.73 
 
 		 610 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.61 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  36.21 
 
 		 422 aa  72  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.73 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  36.08 
 
 		 421 aa  70.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 444 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.88 
 
 		 404 aa  70.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3823  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 354 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 		 319 aa  70.1  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.67 
 
 		 596 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.51 
 
 		 609 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 1171 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 268 aa  69.3  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.31 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.31 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  36.69 
 
 		 550 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.29 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  44.87 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  20.05 
 
 		 701 aa  67.8  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>