More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1538 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
1004 aa  2073    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 
961 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
968 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
984 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  34.38 
 
 
984 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
980 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
796 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
983 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  33.98 
 
 
973 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  44.53 
 
 
746 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.03 
 
 
980 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  35.73 
 
 
938 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
964 aa  476  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  31.92 
 
 
962 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  43.83 
 
 
528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  54.06 
 
 
1060 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  52.63 
 
 
1055 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  53.02 
 
 
1067 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  54.16 
 
 
1056 aa  439  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  53.52 
 
 
1073 aa  436  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  52.15 
 
 
1102 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  52.82 
 
 
1054 aa  419  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  41.37 
 
 
542 aa  416  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  51.65 
 
 
1065 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  51.68 
 
 
1048 aa  399  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  48.66 
 
 
840 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  39.31 
 
 
540 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  47.88 
 
 
1065 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  37.52 
 
 
576 aa  393  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  49.62 
 
 
1061 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
568 aa  379  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
940 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 
515 aa  332  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  49.28 
 
 
840 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  42.18 
 
 
524 aa  254  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  36.91 
 
 
796 aa  243  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
691 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  28.4 
 
 
711 aa  231  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  46.34 
 
 
270 aa  227  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
539 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
544 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.19 
 
 
792 aa  160  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  28.01 
 
 
726 aa  149  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
686 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 
560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  55.21 
 
 
102 aa  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
418 aa  94.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
419 aa  93.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  24.1 
 
 
724 aa  93.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  28.67 
 
 
417 aa  89.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
636 aa  87.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  30.69 
 
 
304 aa  85.9  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
366 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
371 aa  84.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
574 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 
415 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.78 
 
 
637 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  20.86 
 
 
643 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
647 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  38.05 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
635 aa  76.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 
160 aa  75.5  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  36.84 
 
 
760 aa  75.5  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 
654 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1355  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  22.79 
 
 
712 aa  74.7  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
420 aa  73.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
390 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
347 aa  73.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  23.1 
 
 
702 aa  73.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
424 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 
306 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 
649 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  32.81 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  33.91 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  39.29 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.33 
 
 
550 aa  72  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  45.57 
 
 
427 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 
348 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
553 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
434 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 
1171 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
413 aa  70.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
425 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
422 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
351 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
320 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
353 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 
348 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
461 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 
619 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>