More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1901 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 983 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 962 aa  1977    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  37.44 
 
 		 980 aa  619  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  35.36 
 
 		 973 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 		 961 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 968 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 984 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  34.83 
 
 		 984 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 980 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 		 938 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 		 796 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  33.3 
 
 		 940 aa  529  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  33.3 
 
 		 964 aa  502  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 		 1004 aa  462  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  38.25 
 
 		 840 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  51.09 
 
 		 1067 aa  396  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  51.15 
 
 		 1060 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  52.28 
 
 		 1102 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  51.38 
 
 		 1073 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  50.52 
 
 		 1056 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  50.13 
 
 		 1065 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  49.48 
 
 		 1054 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 1055 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  49.74 
 
 		 1048 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  48.6 
 
 		 1061 aa  360  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  46 
 
 		 1065 aa  339  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 746 aa  320  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  30.72 
 
 		 711 aa  311  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  38.58 
 
 		 540 aa  300  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 524 aa  294  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  38.62 
 
 		 528 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 		 542 aa  282  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 576 aa  281  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  52.67 
 
 		 270 aa  268  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  46.62 
 
 		 840 aa  245  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 796 aa  209  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 515 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 539 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 691 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 		 544 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 568 aa  134  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 		 686 aa  121  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 		 560 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  52.08 
 
 		 102 aa  96.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 636 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  21.93 
 
 		 726 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 619 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.93 
 
 		 760 aa  82  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  22.64 
 
 		 724 aa  79.7  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 		 793 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.34 
 
 		 1171 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 422 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 400 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  40.98 
 
 		 160 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 363 aa  77  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  38.14 
 
 		 308 aa  76.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  37.61 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0081  two component transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  32.17 
 
 		 329 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  39.8 
 
 		 450 aa  73.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.78 
 
 		 344 aa  74.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 420 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 269 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 338 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 413 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2012  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 531 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0999069  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 319 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 353 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  36.07 
 
 		 402 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  35.71 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3180  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 		 394 aa  73.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 648 aa  73.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 1335 aa  72.8  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  35.9 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>