More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1919 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  794    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003572  hypothetical protein  36.09 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02528  hypothetical protein  35.81 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1663  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.860701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3396  response regulator receiver protein  34.05 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.759703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0230  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000415135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2713  metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.409072  decreased coverage  0.0000724221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1355  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3428  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3180  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0399  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0458  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0481  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 572 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  32.91 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3549  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  31.82 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  31.08 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  39.33 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 648 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0059  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 		 717 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00476  two-component system regulatory protein with HD-GYP domain  30.96 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 331 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  33.82 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  37.36 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 		 1313 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  36.21 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 861 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  32.66 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 611 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.26 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 868 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  33.83 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  34.15 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3778  response regulator  29.01 
 
 		 629 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  35.06 
 
 		 792 aa  99.8  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  35.06 
 
 		 836 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1421  putative PAS/PAC sensor protein  41.83 
 
 		 535 aa  99.8  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0232449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 353 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.86 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 346 aa  99.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1744  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 452 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1333 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.06 
 
 		 868 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  31.75 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 		 545 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0523  Response regulator protein  32.97 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 654 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0215  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 536 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2755  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 306 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 685 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 160 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  36.87 
 
 		 652 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  33 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>