More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2599 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 796 aa  1615    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  50.68 
 
 		 980 aa  781    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  47.2 
 
 		 938 aa  698    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  84.5 
 
 		 961 aa  1332    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  96.98 
 
 		 968 aa  1545    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  43.95 
 
 		 980 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 		 983 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  41.21 
 
 		 973 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 		 962 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  37.5 
 
 		 984 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 984 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 964 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 		 1004 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 		 940 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  52.57 
 
 		 1060 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  52.01 
 
 		 1055 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  52.52 
 
 		 1056 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  51.85 
 
 		 1067 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  43.29 
 
 		 1073 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  49.89 
 
 		 1065 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  50.48 
 
 		 1102 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  38.44 
 
 		 840 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  47.14 
 
 		 1065 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  47.3 
 
 		 1061 aa  396  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  50.51 
 
 		 1048 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  46.56 
 
 		 1054 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 		 746 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  32.64 
 
 		 540 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  49.65 
 
 		 840 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 		 576 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  49.8 
 
 		 270 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  30.48 
 
 		 711 aa  241  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  35.48 
 
 		 528 aa  230  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 796 aa  224  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 		 515 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 686 aa  168  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 		 691 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 542 aa  148  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 		 539 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  52.08 
 
 		 102 aa  102  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 		 560 aa  101  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 		 544 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 		 702 aa  94  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  24.06 
 
 		 726 aa  90.9  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  39.69 
 
 		 760 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 		 419 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 654 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.33 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3823  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 647 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.24 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 363 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 768 aa  73.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 351 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 422 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 635 aa  73.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.97 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  32.64 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 399 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.16 
 
 		 668 aa  72  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.09 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  46.51 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  22.38 
 
 		 658 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 348 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 418 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  22.38 
 
 		 658 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  44.87 
 
 		 340 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 417 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 413 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.34 
 
 		 596 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 		 347 aa  70.5  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 		 512 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  22.38 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.2 
 
 		 599 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>